57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1191 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  98.09 
 
 		 366 bp  664    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1191    100 
 
 		 367 bp  728    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.737931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  87.84 
 
 		 390 bp  389  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  88.73 
 
 		 1488 bp  379  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  88.73 
 
 		 375 bp  379  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  88.73 
 
 		 375 bp  379  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  88.73 
 
 		 375 bp  379  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  88.73 
 
 		 375 bp  379  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  88.73 
 
 		 375 bp  379  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  88.73 
 
 		 1440 bp  379  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  88.73 
 
 		 375 bp  379  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  88.73 
 
 		 375 bp  379  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  88.73 
 
 		 375 bp  379  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  88.73 
 
 		 2358 bp  379  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  88.63 
 
 		 402 bp  363  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3959  transposase IS3/IS911  90.78 
 
 		 285 bp  250  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  84.06 
 
 		 375 bp  240  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  85.82 
 
 		 330 bp  236  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  86.31 
 
 		 375 bp  236  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  83.77 
 
 		 375 bp  232  6e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  83.77 
 
 		 375 bp  232  6e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1261  transposase IS3/IS911  95.83 
 
 		 162 bp  230  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  84.44 
 
 		 375 bp  192  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  84.44 
 
 		 375 bp  192  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5423    83.7 
 
 		 348 bp  186  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.802579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  84.71 
 
 		 378 bp  121  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6151    88.29 
 
 		 243 bp  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1946    85.71 
 
 		 315 bp  107  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  79.75 
 
 		 387 bp  91.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3375  hypothetical protein  86.32 
 
 		 132 bp  85.7  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422861  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2450  transposase IS3/IS911  81.69 
 
 		 174 bp  75.8  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5095  hypothetical protein  80.28 
 
 		 174 bp  60  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.72528 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0499    94.44 
 
 		 1072 bp  56  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  82.76 
 
 		 300 bp  54  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  90 
 
 		 375 bp  48.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  90 
 
 		 375 bp  48.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  90 
 
 		 375 bp  48.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44610  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase  96.43 
 
 		 1272 bp  48.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>