40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1946 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1946    100 
 
 		 315 bp  624  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1191    85.71 
 
 		 367 bp  107  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.737931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  84.92 
 
 		 366 bp  99.6  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 330 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  86.32 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  85.11 
 
 		 375 bp  75.8  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  85.11 
 
 		 2358 bp  75.8  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  85.11 
 
 		 375 bp  75.8  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  85.11 
 
 		 1440 bp  75.8  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  85.11 
 
 		 375 bp  75.8  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  85.11 
 
 		 375 bp  75.8  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  85.11 
 
 		 375 bp  75.8  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  85.11 
 
 		 1488 bp  75.8  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  85.11 
 
 		 375 bp  75.8  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  85.11 
 
 		 375 bp  75.8  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  85.11 
 
 		 375 bp  75.8  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  84 
 
 		 390 bp  71.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  83.15 
 
 		 375 bp  58  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  83.75 
 
 		 402 bp  56  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>