More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4405 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  65.1 
 
 		 680 aa  894    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  79.41 
 
 		 699 aa  1091    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  55.79 
 
 		 678 aa  700    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  66.37 
 
 		 680 aa  900    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  56.51 
 
 		 682 aa  762    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  64.81 
 
 		 682 aa  834    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  51.99 
 
 		 714 aa  682    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  56.41 
 
 		 704 aa  776    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  69.76 
 
 		 678 aa  933    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  100 
 
 		 690 aa  1396    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  65.59 
 
 		 680 aa  902    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  65.44 
 
 		 686 aa  828    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  59.82 
 
 		 692 aa  816    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  62.26 
 
 		 687 aa  811    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  51.97 
 
 		 802 aa  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  57.9 
 
 		 691 aa  761    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  74.45 
 
 		 679 aa  971    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  60.56 
 
 		 686 aa  821    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  55.35 
 
 		 716 aa  751    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  59.91 
 
 		 683 aa  782    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  67.75 
 
 		 679 aa  922    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  65.59 
 
 		 680 aa  902    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  62.24 
 
 		 681 aa  818    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  67.35 
 
 		 738 aa  911    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  73.71 
 
 		 679 aa  993    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  94.93 
 
 		 690 aa  1325    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  98.7 
 
 		 690 aa  1375    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  66.72 
 
 		 684 aa  896    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  54.88 
 
 		 685 aa  704    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  53.17 
 
 		 689 aa  691    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  62.85 
 
 		 681 aa  841    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  65.59 
 
 		 680 aa  902    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  67.16 
 
 		 680 aa  919    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  45.9 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  45.21 
 
 		 642 aa  544  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  45.88 
 
 		 652 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  42.51 
 
 		 635 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  43.65 
 
 		 647 aa  515  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  42.43 
 
 		 647 aa  514  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  42.36 
 
 		 635 aa  515  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  67.4 
 
 		 846 aa  497  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  44.52 
 
 		 676 aa  489  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  42.22 
 
 		 644 aa  459  9.999999999999999e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  32.79 
 
 		 650 aa  311  2.9999999999999997e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  31.68 
 
 		 600 aa  278  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  29.85 
 
 		 587 aa  195  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  26.77 
 
 		 573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  27.39 
 
 		 583 aa  174  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  31.66 
 
 		 554 aa  171  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  27.77 
 
 		 576 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.77 
 
 		 576 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.03 
 
 		 577 aa  167  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.6 
 
 		 566 aa  160  9e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  26.48 
 
 		 574 aa  158  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.8 
 
 		 566 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.92 
 
 		 542 aa  157  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.84 
 
 		 577 aa  157  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  26.39 
 
 		 552 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.19 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  25.84 
 
 		 575 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.93 
 
 		 591 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  28.71 
 
 		 542 aa  154  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  27.64 
 
 		 559 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  28.97 
 
 		 598 aa  153  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  30.78 
 
 		 599 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  28.83 
 
 		 571 aa  152  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  26.44 
 
 		 562 aa  150  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  29.31 
 
 		 556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  27.18 
 
 		 538 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  24.82 
 
 		 543 aa  147  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  25.92 
 
 		 686 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  27.03 
 
 		 658 aa  147  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  27.38 
 
 		 543 aa  145  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.72 
 
 		 597 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  28.22 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  26.46 
 
 		 564 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  25.91 
 
 		 565 aa  140  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  28.88 
 
 		 550 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  27.11 
 
 		 541 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  28.6 
 
 		 539 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  26.23 
 
 		 552 aa  138  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  27.31 
 
 		 546 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  27.63 
 
 		 611 aa  137  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  28.71 
 
 		 545 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2417  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  25.63 
 
 		 626 aa  136  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.906393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.54 
 
 		 535 aa  135  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  24.82 
 
 		 700 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  27.88 
 
 		 547 aa  135  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  27.27 
 
 		 561 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  24.13 
 
 		 561 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.53 
 
 		 559 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  24.13 
 
 		 561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  27.97 
 
 		 566 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  29.19 
 
 		 590 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  26.96 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  26.63 
 
 		 586 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  26.3 
 
 		 591 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0687  NAD synthetase  27.95 
 
 		 558 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776924  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  26.44 
 
 		 548 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  28.43 
 
 		 544 aa  130  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>