20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2946 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2946  transcription activator effector binding  100 
 
 		 298 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  hitchhiker  0.00143394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2719  transcription activator effector binding  98.44 
 
 		 257 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2841  transcription activator effector binding  85.54 
 
 		 249 aa  431  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.203894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5334  transcription activator effector binding  59.17 
 
 		 255 aa  235  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0182  transcription activator effector binding  55.56 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3657  transcription activator effector binding  55.5 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3021  transcription activator effector binding  43.14 
 
 		 219 aa  136  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0216  transcription activator, effector binding  41.5 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  hitchhiker  0.00731322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  40.82 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  40.82 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0513  transcription activator, effector binding  40.14 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1851  transcription activator effector binding  41.88 
 
 		 241 aa  122  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  40.14 
 
 		 240 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0410  transcription activator effector binding  36.36 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122194  normal  0.857811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3576  transcription activator, effector binding  34.69 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2777  transcription activator, effector binding  35.37 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0772774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  22.79 
 
 		 156 aa  49.3  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  25.55 
 
 		 156 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  26.72 
 
 		 166 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  25.69 
 
 		 152 aa  42.4  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>