27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1342 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 137 aa  269  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  98.54 
 
 		 137 aa  266  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  77.1 
 
 		 148 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  48.18 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  46.72 
 
 		 137 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  48.18 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  47.45 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  59.3 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  53.73 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  51.67 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  50.83 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  50.83 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  49.64 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  54.68 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  50.77 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  55.42 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  51.72 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  54.22 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  44.19 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  45.35 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  45.77 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  38.66 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  46.25 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  41.79 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  40.3 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  31.3 
 
 		 276 aa  42.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>