17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0748 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0748  hypothetical protein  100 
 
 
762 aa  1428    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0707  hypothetical protein  75.41 
 
 
776 aa  861    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579988  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0734  hypothetical protein  96.33 
 
 
768 aa  1215    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2071  hypothetical protein  45.58 
 
 
728 aa  298  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0802327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4469  hypothetical protein  43.38 
 
 
669 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4535  hypothetical protein  40.31 
 
 
699 aa  191  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  27.27 
 
 
478 aa  83.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0977  hypothetical protein  28.85 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1885  hypothetical protein  28.17 
 
 
458 aa  72.8  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1813  hypothetical protein  29.68 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  26.1 
 
 
461 aa  67  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0564  hypothetical protein  32.77 
 
 
446 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0287  hypothetical protein  29.44 
 
 
432 aa  54.7  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0473  hypothetical protein  29.71 
 
 
496 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0120  hypothetical protein  36 
 
 
313 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954008  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0048  hypothetical protein  28.19 
 
 
463 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0313  hypothetical protein  30.86 
 
 
476 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>