23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2284 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2284  30S ribosomal protein S27ae  100 
 
 
49 aa  103  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000131146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0281  30S ribosomal protein S27ae  79.59 
 
 
49 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1325  ribosomal protein S27a  61.22 
 
 
49 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0467  30S ribosomal protein S27ae  60 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1193  30S ribosomal protein S27ae  60 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1441  30S ribosomal protein S27ae  60 
 
 
67 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.168869 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0241  ribosomal protein S27a  61.36 
 
 
61 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.834895 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2867  ribosomal protein S27a  63.64 
 
 
62 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0284  ribosomal protein S27a  60 
 
 
57 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.473204  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0564  Ribosomal protein S27a  55.1 
 
 
50 aa  64.3  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0534  30S ribosomal protein S27a  56.82 
 
 
57 aa  63.9  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1429  30S ribosomal protein S27ae  55.56 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0599  Ribosomal protein S27a  59.09 
 
 
51 aa  63.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470612  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2246  ribosomal protein S27a  56.86 
 
 
51 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  72.41 
 
 
60 aa  55.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03060  ribosomal chaperone, putative  54.17 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.473812  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1172  Ribosomal protein S27a  56.25 
 
 
44 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70249  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73842  Ubiquitin/40S ribosomal protein S27a fusion  52.08 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1272  Ribosomal protein S27a  54.76 
 
 
44 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122795  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04872  Putative uncharacterized proteinUBI1 ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV58]  50 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.171083 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3054  Ribosomal protein S27a  50 
 
 
44 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1955  30S ribosomal protein S27ae  45.83 
 
 
44 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1409  Ribosomal protein S27a  43.75 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>