32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0848 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0848  transposase ISA1083-3, ISORF2  100 
 
 
136 aa  274  3e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1409  transposase  49.06 
 
 
117 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0706153  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  27.64 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1868  IS630 family transposase  34.74 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.8029  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2042  transposase and inactivated derivative  27.96 
 
 
169 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3886  IS630 family transposase  29.59 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00228342  normal  0.0587286 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3674  hypothetical protein  28.97 
 
 
134 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  29.29 
 
 
311 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  24.18 
 
 
380 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  32.26 
 
 
342 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  32.26 
 
 
342 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  32.26 
 
 
342 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  30.61 
 
 
607 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2582  transposase  33.33 
 
 
145 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.667802  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1659  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0595938  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1462  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0282  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0884  transposon protein  33.33 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4113  IS630 family transposase  31.31 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0118  IS630 family transposase  31.31 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2446  putative transposase  33.33 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  28.7 
 
 
322 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  28.7 
 
 
243 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2376  transposase and inactivated derivative  26.77 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.91006  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  33.9 
 
 
346 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3007  IS630 family transposase  32.26 
 
 
179 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3070  IS630 family transposase  32.26 
 
 
179 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3168  IS630 family transposase  32.26 
 
 
179 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4438  IS630 family transposase  32.26 
 
 
179 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6341  IS630 family transposase  32.26 
 
 
179 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7159  IS630 family transposase  32.26 
 
 
179 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0620251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0071  IS630 family transposase  32.26 
 
 
179 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>