More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2010 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  100 
 
 		 448 aa  914    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  61.24 
 
 		 452 aa  566  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2003  nitrogenase  56 
 
 		 450 aa  542  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.577427  normal  0.745673 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0094  Nitrogenase  56.15 
 
 		 450 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.062022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  38.57 
 
 		 463 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  38.65 
 
 		 444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  36.76 
 
 		 460 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  37.1 
 
 		 466 aa  276  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  36.32 
 
 		 459 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1566  nitrogenase  36.2 
 
 		 447 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0772  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  38.25 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2888  oxidoreductase/nitrogenase component 1  30.39 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0772  nitrogenase  33.73 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.59 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  25.06 
 
 		 446 aa  120  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  24.38 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  24.38 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  24.16 
 
 		 458 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  24.83 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1551  nitrogenase, subunit K  24.06 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25 
 
 		 511 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  24.83 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  24.4 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  22.59 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  24.68 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1392  nitrogenase  25.39 
 
 		 462 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.88 
 
 		 489 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  23.56 
 
 		 425 aa  100  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  24.57 
 
 		 462 aa  99.8  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.65 
 
 		 487 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1620  Fe-only nitrogenase, beta subunit  25.88 
 
 		 461 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.855819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.77 
 
 		 455 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.65 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0090  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.97 
 
 		 519 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  23.85 
 
 		 462 aa  98.6  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.16 
 
 		 455 aa  96.7  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.1 
 
 		 489 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  20.26 
 
 		 487 aa  96.3  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1147  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  29.41 
 
 		 465 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0359167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  24.12 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.88 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2613  Fe-only nitrogenase, beta subunit  25.05 
 
 		 462 aa  94.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.67 
 
 		 512 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.28 
 
 		 520 aa  94  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  22.99 
 
 		 461 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.8 
 
 		 459 aa  93.6  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  21.09 
 
 		 489 aa  93.6  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.01 
 
 		 487 aa  93.2  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  23.18 
 
 		 475 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  22.37 
 
 		 475 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  24.92 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.32 
 
 		 489 aa  90.5  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0231  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.08 
 
 		 519 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0556  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  28.77 
 
 		 462 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.263807  normal  0.366302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.41 
 
 		 509 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1607  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.03 
 
 		 519 aa  88.6  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262136  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  22.88 
 
 		 519 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  22.35 
 
 		 462 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.09 
 
 		 513 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3536  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.89 
 
 		 512 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.5 
 
 		 463 aa  87.4  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.26 
 
 		 518 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.01 
 
 		 460 aa  87  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.41 
 
 		 460 aa  87  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3630  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.28 
 
 		 519 aa  87  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5099  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.13 
 
 		 519 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  27.67 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.94 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.49 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1075  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.25 
 
 		 537 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.902597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.54 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.83 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0971  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.68 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5054  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.01 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.49 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.75 
 
 		 511 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.75 
 
 		 511 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.66 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  23.87 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0164  hypothetical protein  26.26 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.78 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4932  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.96 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  21.69 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  22.81 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.83 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0166  nitrogenase associated protein E  28.69 
 
 		 518 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1012  nitrogenase  25.16 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.09 
 
 		 524 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.64 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.33 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2343  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.67 
 
 		 519 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.33 
 
 		 516 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.49 
 
 		 523 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1998  nitrogenase  26.12 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.9 
 
 		 518 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  28.11 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.13 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  27.4 
 
 		 516 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1015  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.26 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.62 
 
 		 512 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>