33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1882 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1882  translation initiation factor IF-6  100 
 
 		 220 aa  429  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0937333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1968  translation initiation factor IF-6  64.55 
 
 		 220 aa  281  6.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0540  translation initiation factor IF-6  60.45 
 
 		 221 aa  270  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000169194  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3020  translation initiation factor IF-6  58.18 
 
 		 221 aa  256  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1478  translation initiation factor IF-6  54.5 
 
 		 222 aa  248  7e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000242124  hitchhiker  0.000577571 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1567  translation initiation factor IF-6  49.77 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0826  translation initiation factor IF-6  43.32 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00606754  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1818  translation initiation factor eIF-6  42.79 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0459  translation initiation factor IF-6  41.07 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0113  translation initiation factor IF-6  42.47 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0998  translation initiation factor IF-6  39.91 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1232  translation initiation factor eIF-6  40.28 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0028  translation initiation factor eIF-6  38.64 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0235  translation initiation factor eIF-6  41.89 
 
 		 221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66051  predicted protein  36.04 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0865921  normal  0.408575 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08824  translation initiation factor eIF-6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06010)  36.57 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00475287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0474  translation initiation factor IF-6  34.58 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0458  translation initiation factor IF-6  34.76 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00650  eukaryotic translation initiation factor 6 (eif-6), putative  34.4 
 
 		 245 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24493  predicted protein  33.33 
 
 		 249 aa  114  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608395  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1628  translation initiation factor IF-6  32.13 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000860601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1826  translation initiation factor IF-6  31.43 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.644834 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0237  translation initiation factor IF-6  32.69 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119613  eukaryotic translation initiation factor 6  33.33 
 
 		 256 aa  108  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.514842  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1662  translation initiation factor IF-6  31.9 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0199  translation initiation factor IF-6  31.6 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0856043  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1323  translation initiation factor eIF-6  33.03 
 
 		 223 aa  104  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1608  translation initiation factor IF-6  30.48 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1076  translation initiation factor IF-6  30.97 
 
 		 227 aa  88.2  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0125  translation initiation factor IF-6  27.91 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.079136  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0889  translation initiation factor IF-6  27.68 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1058  translation initiation factor IF-6  27.63 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1616  translation initiation factor IF-6  27.63 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>