14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1713 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1713  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  650    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.717122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1555  hypothetical protein  28.57 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0980  hypothetical protein  35.82 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1314  hypothetical protein  32.8 
 
 		 281 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  30.41 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  30.41 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  28.1 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  32.12 
 
 		 300 aa  53.1  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  27.54 
 
 		 373 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  25.64 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  25.79 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33738  predicted protein  25.62 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0455697  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  27.98 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  27.96 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>