18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0540 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0540  ribonuclease P, Rpp29  100 
 
 		 88 aa  177  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.116302  normal  0.780083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0572  ribonuclease P, Rpp29  60 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270481  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0450  Ribonuclease P, Rpp29  50.59 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0208067  normal  0.676898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2245  ribonuclease P subunit  47.06 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000149463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1720  ribonuclease P, Rpp29  45.98 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000678926  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0486  ribonuclease P, Rpp29  42.53 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0802  ribonuclease P  35.29 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.462898 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1392  ribonuclease P protein component 1  41.57 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0102  ribonuclease P protein component 1  42.05 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.276716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0718  ribonuclease P protein component 1  38.04 
 
 		 99 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00304723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2441  ribonuclease P protein component 1  42.19 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.616696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0009  ribonuclease P protein component 1  40.23 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000469869  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1513  Ribonuclease P, Rpp29  39.08 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.42497e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1266  ribonuclease P protein component 1  37.36 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000002979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1836  Ribonuclease P, Rpp29  31.11 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.670408 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0171  ribonuclease P protein component 1  38.04 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0652  ribonuclease P protein component 1  37.36 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000000274368  decreased coverage  0.0000593448 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2300  ribonuclease P protein component 1  27.66 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>