35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0024 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0024  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0048  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.048263  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0022  tRNA-Lys  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.622562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0006  tRNA-Lys  89.19 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0003  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237532  decreased coverage  0.00216648 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0047  tRNA-Lys  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271132  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0019  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.964616  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0047  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0032  tRNA-Trp  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0047  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0045  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0045  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0014  tRNA-Lys  85.29 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289173  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0049  tRNA-Lys  83.82 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0073  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.515565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 96 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0011  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.312587  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0040  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00746142 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0014  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247268  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0057  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0039  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0006  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0016  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000757074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0038  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.944323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0035  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0042  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0034  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0031  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0026  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0144424  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0023  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0236487  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0037  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.279922 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0013  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0012  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>