17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0037 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0037  tRNA-Lys  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.279922 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0026  tRNA-Lys  91.67 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  89.74 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33730  tRNA-Lys  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0071  tRNA-Lys  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641081  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01680  tRNA-Lys  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0024  tRNA-Lys  82.43 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0043  tRNA-Arg  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0021  tRNA-Trp  85.19 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000328782  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09730  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24780  tRNA-Lys  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190914  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0049  tRNA-Lys  86.96 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0045  tRNA-Arg  91.18 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0259026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>