74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3413 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3413  putative ferredoxin  100 
 
 		 53 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.750023  normal  0.917562 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1300  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  76 
 
 		 53 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.23 
 
 		 589 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2544  putative ferredoxin  54 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  42.59 
 
 		 306 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0621  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.98 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.08 
 
 		 239 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.537791  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48 
 
 		 392 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000007278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.66 
 
 		 421 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0532  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50 
 
 		 55 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000183692  normal  0.0950225 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1172  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  48.08 
 
 		 594 aa  47  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  38.18 
 
 		 322 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0556  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 		 52 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.71796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0517  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 53 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0471741  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0870  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  42.22 
 
 		 291 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0282  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48 
 
 		 52 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 		 55 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000062189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2278  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.06 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1945  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.06 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2229  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000195937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 361 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42 
 
 		 356 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0307  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  43.4 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.889115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1551  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  43.14 
 
 		 289 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02630  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  58.49 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.862545 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01385  conserved ferredoxin-related protein  39.53 
 
 		 633 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1241  ferredoxin family protein  40.35 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.251684  normal  0.0451259 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0441  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.65 
 
 		 848 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2390  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin) alpha and beta subunits-like  46.81 
 
 		 215 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000111443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1753  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.1 
 
 		 55 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000316895  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1362  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48 
 
 		 52 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.274996  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0285  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  41.94 
 
 		 340 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0862622  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 373 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.38221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.82 
 
 		 301 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.17 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.17 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  44.23 
 
 		 634 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1210  aldo/keto reductase  41.67 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48 
 
 		 331 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1568  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1848  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.78 
 
 		 604 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 431 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.18 
 
 		 285 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2708  ferredoxin family protein  46 
 
 		 56 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0551  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.21 
 
 		 425 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0206  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  43.48 
 
 		 301 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0800  hypothetical protein  44.68 
 
 		 324 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.1 
 
 		 277 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232825  normal  0.226178 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 		 369 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.67 
 
 		 427 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0914  aldo/keto reductase  38.78 
 
 		 316 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.288271  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.78 
 
 		 264 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.33 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.43 
 
 		 292 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.9 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.59 
 
 		 397 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  40 
 
 		 306 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1479  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.14 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.150596  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0980  glycyl-radical activating family protein  44.68 
 
 		 297 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.131362 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1973  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  39.22 
 
 		 291 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  36 
 
 		 271 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0679  ferredoxin  44 
 
 		 57 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.51 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803989  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.69 
 
 		 371 aa  40.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00514975  hitchhiker  0.000746109 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1109  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.67 
 
 		 365 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.195082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0830  putative electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.46 
 
 		 280 aa  40.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.214006  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  34.09 
 
 		 434 aa  40.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  40.74 
 
 		 410 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1727  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.64 
 
 		 316 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  40.74 
 
 		 410 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 410 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48.89 
 
 		 266 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.64 
 
 		 63 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.604017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 131 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>