More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3350 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  76.69 
 
 
400 aa  653    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  100 
 
 
398 aa  830    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  72.43 
 
 
400 aa  621  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  73.12 
 
 
399 aa  619  1e-176  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  71.36 
 
 
406 aa  611  9.999999999999999e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0529  aldo/keto reductase  62.06 
 
 
400 aa  521  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  59.19 
 
 
397 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1455  aldo/keto reductase  57.29 
 
 
399 aa  473  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.981784  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  56.96 
 
 
410 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  54.77 
 
 
401 aa  463  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  54.86 
 
 
413 aa  457  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  55.24 
 
 
409 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  53.93 
 
 
409 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1653  aldo/keto reductase  56.17 
 
 
381 aa  434  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.953335 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.26 
 
 
382 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2019  aldo/keto reductase  55.26 
 
 
380 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  52.36 
 
 
383 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  50.79 
 
 
408 aa  411  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  50.52 
 
 
377 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  48.36 
 
 
396 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  51.83 
 
 
377 aa  392  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  47.29 
 
 
384 aa  390  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  48.43 
 
 
376 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  48.78 
 
 
379 aa  375  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  46.6 
 
 
379 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  46.6 
 
 
379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  42.6 
 
 
381 aa  350  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  47.23 
 
 
376 aa  349  5e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  44.97 
 
 
397 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  43.9 
 
 
371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0448  aldo/keto reductase  39.41 
 
 
374 aa  281  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04990  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  35.14 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  34.13 
 
 
370 aa  207  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  35.6 
 
 
376 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0222  aldo/keto reductase  35.2 
 
 
375 aa  203  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.782387  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  36.34 
 
 
374 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0701  aldo/keto reductase  32.98 
 
 
368 aa  199  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0135874  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0769  Fe-S oxidoreductase  31.65 
 
 
379 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000125779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2587  aldo/keto reductase  32.27 
 
 
368 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1057  aldo/keto reductase  30.71 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1621  aldo/keto reductase  30.24 
 
 
380 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2567  aldo/keto reductase  27.53 
 
 
371 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.17886  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1414  aldo/keto reductase  27.71 
 
 
386 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2764  aldo/keto reductase  26.75 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  31.2 
 
 
337 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3250  aldo/keto reductase  28.31 
 
 
364 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0504  aldo/keto reductase  27.09 
 
 
376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122684  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0241  aldo/keto reductase  28.14 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.036795 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  28.91 
 
 
365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3197  aldo/keto reductase  26.65 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000351042  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0407  aldo/keto reductase  25.51 
 
 
383 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2899  aldo/keto reductase  26.4 
 
 
374 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  27.06 
 
 
340 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0602  oxidoreductase  25.38 
 
 
373 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04651  aldo/keto reductase  26.84 
 
 
380 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.205889  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1070  oxidoreductase aldo/keto reductase  26.7 
 
 
373 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587482  hitchhiker  0.00485834 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  27.58 
 
 
350 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04961  aldo/keto reductase  26.72 
 
 
365 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.583752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  27.93 
 
 
343 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05031  aldo/keto reductase  25.2 
 
 
380 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  29.41 
 
 
355 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06351  aldo/keto reductase family protein  24.81 
 
 
378 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.162815 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1760  oxidoreductase  25.94 
 
 
373 aa  99  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0440  aldo/keto reductase  25.73 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102195  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04381  aldo/keto reductase  26.84 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  25.55 
 
 
370 aa  96.7  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  25.62 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0779  hypothetical protein  23.81 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000590838 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  28.9 
 
 
349 aa  93.6  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  30.55 
 
 
352 aa  93.2  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0446  aldo/keto reductase  27.12 
 
 
320 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  27.44 
 
 
309 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  29.45 
 
 
352 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  26.4 
 
 
308 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  28 
 
 
302 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  29.39 
 
 
354 aa  90.5  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  27.94 
 
 
343 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  25.71 
 
 
308 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06340  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  26.4 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  28.8 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  26.69 
 
 
326 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  28.99 
 
 
322 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  27.79 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  28.37 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  28.09 
 
 
327 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0272  aldo/keto reductase  23.38 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  26.92 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  27.86 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  27.02 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  26.81 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  24.02 
 
 
361 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  27.33 
 
 
316 aa  84  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.11 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  28.05 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  28.99 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  34.67 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  29.33 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  26.17 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3226  aldo/keto reductase  28.38 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  27.67 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>