18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2522 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2522  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  810    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.101837  normal  0.542859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2120  hypothetical protein  51.16 
 
 
389 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2315  hypothetical protein  41 
 
 
397 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0732  hypothetical protein  38.34 
 
 
382 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0021  hypothetical protein  41.19 
 
 
382 aa  288  8e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04270  hypothetical protein  33.68 
 
 
388 aa  237  3e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  22.08 
 
 
401 aa  46.6  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  22.93 
 
 
437 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.4 
 
 
403 aa  46.6  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.4 
 
 
403 aa  46.6  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  27.12 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  27.43 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.5 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  23.57 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25.62 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.48 
 
 
389 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  24.14 
 
 
321 aa  43.1  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  21.52 
 
 
411 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>