29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1896 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1896  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  667    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2531  hypothetical protein  33.44 
 
 		 318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000779725  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1918  hypothetical protein  29.91 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3314  hypothetical protein  45.63 
 
 		 453 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0908222 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1085  hypothetical protein  63.49 
 
 		 290 aa  93.2  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1819  hypothetical protein  34.45 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1134  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 232 aa  52.8  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0464  hypothetical protein  36.92 
 
 		 465 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00621297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2512  membrane protein  41.38 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1400  regulatory protein MarR  44.44 
 
 		 452 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2548  hypothetical protein  37.7 
 
 		 389 aa  49.3  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.140695 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1381  hypothetical protein  32.93 
 
 		 434 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0508  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 453 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.508311  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0388  hypothetical protein  36.92 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1199  hypothetical protein  37.23 
 
 		 181 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1271  hypothetical protein  36.84 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.486206 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1389  hypothetical protein  42.37 
 
 		 453 aa  46.6  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3340  hypothetical protein  30 
 
 		 425 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0332  hypothetical protein  35.71 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3289  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5171  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  35.59 
 
 		 168 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2437  hypothetical protein  33.87 
 
 		 469 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813144  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0822  hypothetical protein  42.25 
 
 		 529 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1236  regulatory protein, MarR  39.68 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149898  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1427  hypothetical protein  37.74 
 
 		 444 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1142  hypothetical protein  32.88 
 
 		 216 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2831  hypothetical protein  41.67 
 
 		 202 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3612  hypothetical protein  29.31 
 
 		 388 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0584  transcriptional regulator, TrmB  37.7 
 
 		 355 aa  42.4  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000506573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>