35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1140 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1140  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  723    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1110  hypothetical protein  58.5 
 
 		 347 aa  430  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.506924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1116  hypothetical protein  48.7 
 
 		 349 aa  345  6e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0383  hypothetical protein  45.02 
 
 		 342 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3424  hypothetical protein  31.77 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4421  hypothetical protein  25 
 
 		 420 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  0.170958 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0581  polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 		 470 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0766  hypothetical protein  27.81 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.249559 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3172  hypothetical protein  28.29 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1371  hypothetical protein  29.79 
 
 		 470 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2497  hypothetical protein  29.7 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1832  hypothetical protein  31.6 
 
 		 280 aa  126  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1737  hypothetical protein  26.95 
 
 		 469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1599  hypothetical protein  26.77 
 
 		 466 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1559  hypothetical protein  26.28 
 
 		 478 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462896  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3968  hypothetical protein  25.25 
 
 		 501 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0443888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0814  hypothetical protein  25.39 
 
 		 485 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1128  hypothetical protein  25.64 
 
 		 495 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0883  hypothetical protein  34.69 
 
 		 453 aa  87.4  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.985622 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05615  hypothetical protein  23.4 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.776737  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  23.7 
 
 		 293 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 281 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  23.87 
 
 		 295 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  23.22 
 
 		 279 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  23.71 
 
 		 302 aa  46.2  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  23.7 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  23.42 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  23.42 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.27 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  23.7 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  23.7 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  23.7 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  25.48 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  21.19 
 
 		 276 aa  42.7  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>