165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0346 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0346  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  747    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.949651 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1037  hypothetical protein  79.08 
 
 		 370 aa  598  1e-170  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00782668  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0106  hypothetical protein  64.66 
 
 		 369 aa  488  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1733  hypothetical protein  53.07 
 
 		 354 aa  378  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0679  methanogenesis marker 13 metalloprotein  53.07 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.682238  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1419  hypothetical protein  53.46 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0746849 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0670  hypothetical protein  52.25 
 
 		 354 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0520  hypothetical protein  52.51 
 
 		 353 aa  361  1e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.268419  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1313  vanadium nitrogenase-associated related protein N  41.27 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1413  vanadium nitrogenase-associated related protein N  41.76 
 
 		 366 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1209  vanadium nitrogenase-associated related protein N  42.29 
 
 		 366 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1425  vanadium nitrogenase-associated related protein N  43.35 
 
 		 366 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158785  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0483  vanadium nitrogenase-associated related protein N  43.88 
 
 		 366 aa  272  9e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0604601  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1952  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  40.21 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0543638  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0682  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.78 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0741  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.78 
 
 		 546 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1630  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.93 
 
 		 542 aa  63.5  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000671543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1247  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.76 
 
 		 544 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0023858  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1531  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  38.14 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  36.73 
 
 		 540 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  33.91 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  34.78 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1998  nitrogenase  34.21 
 
 		 512 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  34.04 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2818  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  34.69 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.365321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  30.3 
 
 		 545 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1155  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  31.91 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0773  nitrogenase  26.67 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  32.17 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  30 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0837  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  33.7 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  33.33 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  28 
 
 		 458 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  28 
 
 		 458 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0168  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  35.16 
 
 		 533 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488812  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  31.18 
 
 		 544 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  30.39 
 
 		 542 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  28.7 
 
 		 458 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1016  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  32.65 
 
 		 551 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  27.14 
 
 		 475 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  27.51 
 
 		 509 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  30.82 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0507  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.06 
 
 		 467 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  29.51 
 
 		 509 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  30 
 
 		 466 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  27.14 
 
 		 475 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2003  nitrogenase  29.66 
 
 		 450 aa  53.5  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.577427  normal  0.745673 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0094  Nitrogenase  27.78 
 
 		 450 aa  53.1  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.062022 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  29.46 
 
 		 462 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  27.14 
 
 		 458 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  29.46 
 
 		 462 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  33.64 
 
 		 546 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.59 
 
 		 506 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  30.84 
 
 		 448 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2077  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  30.43 
 
 		 918 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  28.57 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  30.77 
 
 		 462 aa  50.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.49 
 
 		 511 aa  50.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.59 
 
 		 506 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3536  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.81 
 
 		 512 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.59 
 
 		 516 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2142  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  30.56 
 
 		 918 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0853728 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.96 
 
 		 513 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  28.83 
 
 		 425 aa  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  28.04 
 
 		 505 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5054  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.81 
 
 		 513 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1199  nitrogenase component I, alpha chain  30.69 
 
 		 476 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2908  Nitrogenase  31.37 
 
 		 502 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  28.57 
 
 		 469 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25.36 
 
 		 430 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.12 
 
 		 518 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  27.5 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0166  nitrogenase associated protein E  30.28 
 
 		 518 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0313  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  29.13 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000260706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3468  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  32.71 
 
 		 481 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3491  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  28.46 
 
 		 919 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  27.78 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0639  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  24.52 
 
 		 915 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.835283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  28.7 
 
 		 917 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02610  vanadium nitrogenase, alpha subunit, vnfD  29.13 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4932  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.48 
 
 		 510 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0669  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  26 
 
 		 919 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.961568 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3206  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  28.16 
 
 		 918 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0476  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  32.38 
 
 		 629 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4041  nitrogenase component I, alpha chain  30.69 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  37.31 
 
 		 470 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.615494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2117  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  33 
 
 		 467 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0140649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26.09 
 
 		 459 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0091  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  33.01 
 
 		 633 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.77225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1788  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  37.31 
 
 		 470 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.34 
 
 		 518 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26.77 
 
 		 460 aa  47.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.37 
 
 		 512 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1943  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  29.06 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1012  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.81 
 
 		 510 aa  46.6  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1050  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  32.94 
 
 		 477 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1350  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.69 
 
 		 455 aa  46.2  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.452769  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  28.57 
 
 		 477 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3932  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.65 
 
 		 480 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.844513  normal  0.0730658 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>