12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2876 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2876  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 103 aa  195  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0584958  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000052  putative transmembrane protein  56.32 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.323073  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2037  putative transmembrane protein  56.32 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1319  branched-chain amino acid transport  39.13 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1825  branched chain amino acid ABC transporter  31.96 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1995  branched-chain amino acid transport  39.39 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4139  branched-chain amino acid transport  29.67 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1764  branched-chain amino acid transport  35.38 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240182  normal  0.0440928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3748  branched-chain amino acid transport  34.65 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0805425  normal  0.238861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4738  branched-chain amino acid transport  35.09 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  29.33 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1118  branched-chain amino acid transport  39.39 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>