28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1390 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1390  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  328  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3249  hypothetical protein  88.61 
 
 
158 aa  293  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00452739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1271  hypothetical protein  88.61 
 
 
158 aa  293  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1576  hypothetical protein  28.08 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.678852  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2005  hypothetical protein  30.91 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00021351  hitchhiker  0.000000141582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1970  hypothetical protein  30.91 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000508823  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3142  hypothetical protein  32.85 
 
 
163 aa  57.8  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00589306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2365  hypothetical protein  30.36 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1577  hypothetical protein  26.53 
 
 
130 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2009  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000579412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1984  hypothetical protein  28.18 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000029351  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0043  hypothetical protein  35.94 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.761972  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2106  hypothetical protein  25.45 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121868  normal  0.452338 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0095  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100941  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4486  hypothetical protein  29.46 
 
 
161 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2200  hypothetical protein  28.68 
 
 
150 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2213  hypothetical protein  29.2 
 
 
150 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  29.57 
 
 
158 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2210  hypothetical protein  28.92 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120945  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2221  hypothetical protein  25.45 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000880424  normal  0.25123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2171  hypothetical protein  25.45 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00980217  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1922  hypothetical protein  28.12 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1812  hypothetical protein  21.9 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.639784  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04843  hypothetical protein  28.23 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2426  hypothetical protein  25.45 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0117545  hitchhiker  0.0000688315 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0795  membrane protein  33.33 
 
 
146 aa  42  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1790  hypothetical protein  25.66 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0036932  normal  0.183021 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1816  hypothetical protein  26.72 
 
 
172 aa  40.4  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103062  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>