18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1577 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1577  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  270  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1812  hypothetical protein  52.67 
 
 
142 aa  135  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.639784  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1368  hypothetical protein  57.8 
 
 
142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.963563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2080  hypothetical protein  51.33 
 
 
141 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1337  FixH family protein  33.68 
 
 
266 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1235  hypothetical protein  33.68 
 
 
266 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1175  hypothetical protein  31.58 
 
 
265 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0043  hypothetical protein  33.03 
 
 
164 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.761972  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1223  hypothetical protein  29.41 
 
 
283 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.808212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1390  hypothetical protein  26.53 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3249  hypothetical protein  27.55 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00452739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1271  hypothetical protein  27.55 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  31.09 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1922  hypothetical protein  25.38 
 
 
164 aa  51.2  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1816  hypothetical protein  27.19 
 
 
172 aa  50.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103062  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1576  hypothetical protein  28.57 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.678852  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2426  hypothetical protein  28.33 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0117545  hitchhiker  0.0000688315 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2365  hypothetical protein  29.01 
 
 
161 aa  41.2  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>