14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0095 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0095  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  291  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100941  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04843  hypothetical protein  48.23 
 
 
141 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0795  membrane protein  37.23 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001100  hypothetical protein  66.04 
 
 
53 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.988941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1390  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0043  hypothetical protein  42.55 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.761972  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1271  hypothetical protein  31.94 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3249  hypothetical protein  31.94 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00452739  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0871  hypothetical protein  30.61 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0035  putative periplasmic protein  24.73 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0541  hypothetical protein  41.03 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  26.23 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1576  hypothetical protein  40.54 
 
 
156 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.678852  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1816  hypothetical protein  30 
 
 
172 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103062  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>