26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1152 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1152  type II secretion system protein  100 
 
 
295 aa  588  1e-167  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1035  type II secretion system protein  58.84 
 
 
298 aa  354  7.999999999999999e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0911  type II secretion system protein  58.86 
 
 
298 aa  353  2e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1642  type II secretion system protein  57.53 
 
 
298 aa  348  9e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.226081  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1035  type II secretion system protein  58.19 
 
 
298 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.124398 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1053  hypothetical protein  55.56 
 
 
198 aa  186  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.380793  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1047  hypothetical protein  55.56 
 
 
198 aa  186  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1041  hypothetical protein  55.56 
 
 
198 aa  186  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  28.03 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  26.77 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  23.41 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  24.64 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  25.93 
 
 
275 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  23.85 
 
 
309 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  28.57 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  24.67 
 
 
660 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  30.2 
 
 
320 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  24.21 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  24 
 
 
325 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  23.38 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  24.04 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  28 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  21.17 
 
 
316 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  26.12 
 
 
283 aa  42.7  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  23.53 
 
 
323 aa  42.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  19.25 
 
 
322 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>