14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2686 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2686  hypothetical protein  100 
 
 		 913 aa  1868    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0095  hypothetical protein  81.71 
 
 		 910 aa  1503    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3102  hypothetical protein  81.58 
 
 		 914 aa  1517    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2127  hypothetical protein  82.15 
 
 		 911 aa  1541    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  24.12 
 
 		 834 aa  104  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.34 
 
 		 1068 aa  92.8  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  22.2 
 
 		 814 aa  90.9  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.86 
 
 		 1068 aa  88.6  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.47 
 
 		 1115 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  23.36 
 
 		 1122 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1094 aa  52  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1099 aa  52  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  25.76 
 
 		 865 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  24.93 
 
 		 941 aa  47.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>