More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0887 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  100 
 
 
316 aa  648    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  59.15 
 
 
330 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  59.09 
 
 
358 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  59.09 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  50.78 
 
 
327 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  59.32 
 
 
349 aa  333  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0171  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0534  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0780  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0844  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0902  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0903  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1166  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1188  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.584401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1229  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1310  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1315  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2008  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2010  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2234  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2324  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000979415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2328  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00380976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2426  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2432  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000860937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2541  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2836  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2887  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00537517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3194  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0837027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3731  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3963  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4152  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4253  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4347  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4596  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4643  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4702  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4971  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5428  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5440  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5556  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5564  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5582  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  50.47 
 
 
326 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  50.47 
 
 
326 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  50.47 
 
 
326 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  50.47 
 
 
326 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  51.23 
 
 
326 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3208  ISPssy, transposase  51.08 
 
 
338 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0135274  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  52.02 
 
 
327 aa  323  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  51.41 
 
 
328 aa  322  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  51.41 
 
 
328 aa  322  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04748  ISXo1 transposase  51.57 
 
 
322 aa  322  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01862  ISXo1 transposase  51.57 
 
 
322 aa  322  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04850  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0577284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05625  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0316217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05516  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05689  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05577  ISXo1 transposase  51.57 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06239  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04707  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05526  ISXo1 transposase  51.57 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00284  ISXo1 transposase  51.57 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.454777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04603  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01080  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000904995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02738  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00267  ISXo1 transposase  51.57 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01858  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04167  ISXo1 transposase  51.57 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06088  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03194  ISXo1 transposase  51.57 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00278  ISXo1 transposase  51.57 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00491  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04722  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04676  ISXo1 transposase  51.57 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01751  ISXo1 transposase  51.57 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05639  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  319  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04767  ISXo1 transposase  50.94 
 
 
322 aa  320  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02304  ISXo1 transposase  50.94 
 
 
322 aa  320  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04034  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01500  ISXo1 transposase  51.26 
 
 
322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.549499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  49.22 
 
 
326 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  50.16 
 
 
326 aa  318  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  52.5 
 
 
331 aa  318  7e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00368  ISXo1 transposase  50.94 
 
 
322 aa  318  9e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.161909  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  49.84 
 
 
326 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03937  ISXoo6 transposase  52.81 
 
 
405 aa  315  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  52.81 
 
 
326 aa  315  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  52.35 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  52.08 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  52.19 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  47.98 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  52.08 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03428  ISXoo6 transposase  52.85 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1308  ISRSO18-transposase protein  50.79 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  50.64 
 
 
326 aa  310  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2494  transposase, IS4 family protein  48.41 
 
 
320 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0455823  decreased coverage  0.00299337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1557  transposase, IS4 family protein  48.41 
 
 
320 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3460  transposase, IS4 family protein  48.41 
 
 
320 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2970  transposase IS4 family protein  50.64 
 
 
326 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.646128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3076  transposase IS4 family protein  50.64 
 
 
326 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>