More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02865 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  100 
 
 		 254 aa  522  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.44 
 
 		 263 aa  326  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.32 
 
 		 263 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.32 
 
 		 263 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.92 
 
 		 263 aa  321  8e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  59.92 
 
 		 263 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  58.73 
 
 		 263 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.52 
 
 		 263 aa  318  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.32 
 
 		 263 aa  318  6e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.32 
 
 		 263 aa  318  6e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.32 
 
 		 263 aa  318  6e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.32 
 
 		 263 aa  318  6e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.73 
 
 		 263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  59.52 
 
 		 262 aa  311  4.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.75 
 
 		 263 aa  308  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.94 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.94 
 
 		 263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.03 
 
 		 259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.71 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  54.33 
 
 		 259 aa  294  8e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  53.94 
 
 		 259 aa  293  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  52.76 
 
 		 258 aa  287  9e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.97 
 
 		 262 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  52.57 
 
 		 255 aa  282  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0990  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.15 
 
 		 265 aa  280  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37153  normal  0.791697 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.98 
 
 		 265 aa  278  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.45 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.6 
 
 		 262 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 		 257 aa  261  8e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.21 
 
 		 262 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  49.21 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.6 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.22 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  48.19 
 
 		 262 aa  252  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.19 
 
 		 262 aa  252  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  46.83 
 
 		 262 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  46.83 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.62 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2157  putative plasmid partitioning protein  50.81 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1182  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.33 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14884 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.62 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.61 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  43.78 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  38.71 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  38.4 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  38.4 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.8 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.71 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  37.1 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.31 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.84 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.69 
 
 		 284 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.44 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.69 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  33.73 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.31 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.29 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.55 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.89 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 		 306 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.69 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.29 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.29 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.69 
 
 		 303 aa  162  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.29 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.29 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  36.29 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.29 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.69 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  36.95 
 
 		 290 aa  162  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.29 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.33 
 
 		 253 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.29 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  34.68 
 
 		 293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  36.55 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  37.1 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.1 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.68 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  35.48 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.47 
 
 		 322 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.89 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.29 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.89 
 
 		 290 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.89 
 
 		 290 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.8 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.89 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  36.28 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  33.2 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  33.61 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.69 
 
 		 263 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.68 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.77 
 
 		 297 aa  158  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  36.73 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  36.69 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.89 
 
 		 362 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.66 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.96 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.68 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  33.47 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>