12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01309 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01309  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  760    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.127385  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1200  hypothetical protein  29.8 
 
 		 378 aa  119  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0159  hypothetical protein  27.3 
 
 		 370 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  25.86 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1556  cellulose biosynthesis protein CelD  24.3 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3071  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.03 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1801  cellulose biosynthesis protein CelD  32 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3884  hypothetical protein  23.05 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  26.87 
 
 		 550 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5003  hypothetical protein  23.63 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.403885  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  26.87 
 
 		 550 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  27.09 
 
 		 506 aa  42.7  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.907164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>