46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00228 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00228  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  590  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3869  hypothetical protein  27.41 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3599  hypothetical protein  28.36 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  21.63 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  23.04 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  25.26 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2105  hypothetical protein  31.39 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290661  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  24.26 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2845  temperature sensitive supressor-like  24.74 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  26.44 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  22.6 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  20.97 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  23.44 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  27.14 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  24.71 
 
 		 278 aa  49.7  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  22.71 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  25 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  23.5 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  21.76 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  22.22 
 
 		 271 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  24.68 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  24.62 
 
 		 266 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  23.56 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  24.11 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  24.11 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  24.11 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  24.68 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  24.02 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  23.27 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  24.81 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3438  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  23.44 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.215264  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  24.68 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2272  hypothetical protein  27.13 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  24.68 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  24.68 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  24.68 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  24.62 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  24.24 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  23.19 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  24.68 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  24.11 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  23.03 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  24.26 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  19.41 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  19.83 
 
 		 265 aa  42  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>