278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5353 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5353  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 412 aa  825    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6086  allantoate amidohydrolase  91.99 
 
 		 412 aa  728    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.891252  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7813  allantoate amidohydrolase  51.34 
 
 		 415 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  45.76 
 
 		 424 aa  338  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0348  allantoate amidohydrolase  43.9 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  44.15 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  42.51 
 
 		 416 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0293  allantoate amidohydrolase  43.9 
 
 		 415 aa  328  8e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0374467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  45.1 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  44.58 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.12 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.12 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  43.87 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  41.56 
 
 		 420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  42.82 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  41.95 
 
 		 416 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  42.79 
 
 		 426 aa  318  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  42.44 
 
 		 425 aa  315  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  43.38 
 
 		 411 aa  315  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  43.24 
 
 		 415 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.31 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.89 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  43.14 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  43.38 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  42.16 
 
 		 426 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  45.34 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3291  allantoate amidohydrolase  42.01 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17984  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3036  allantoate amidohydrolase  42.89 
 
 		 417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  42.65 
 
 		 426 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  42.75 
 
 		 426 aa  309  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  42.89 
 
 		 426 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1461  allantoate amidohydrolase  42.51 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  43.07 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  42.89 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  42.89 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  45.34 
 
 		 429 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2366  allantoate amidohydrolase  41.77 
 
 		 416 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.291014  normal  0.850534 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  43.46 
 
 		 418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  43.46 
 
 		 418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  43.7 
 
 		 418 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  45.34 
 
 		 523 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  43.46 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  46.06 
 
 		 414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  40.69 
 
 		 411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  43.46 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.01 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  41.71 
 
 		 442 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  41.86 
 
 		 427 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0184  allantoate amidohydrolase  42.65 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1817  allantoate amidohydrolase  42.65 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  0.138716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  41.18 
 
 		 413 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  43.17 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  46.08 
 
 		 424 aa  299  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  43.77 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3455  allantoate amidohydrolase  40.64 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  41.18 
 
 		 412 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1247  amidase  42.71 
 
 		 408 aa  297  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  42.79 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  42.05 
 
 		 420 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  39.66 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  42.12 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  41.87 
 
 		 427 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  42.54 
 
 		 427 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  43.21 
 
 		 423 aa  292  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  43.28 
 
 		 418 aa  292  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  41.18 
 
 		 416 aa  292  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  41.91 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  42.54 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  42.12 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  38.95 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  42.58 
 
 		 412 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.32 
 
 		 412 aa  289  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  41.32 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  40.05 
 
 		 479 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  41.67 
 
 		 421 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  40.49 
 
 		 423 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  43.77 
 
 		 420 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  40.93 
 
 		 418 aa  286  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.2 
 
 		 428 aa  285  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  41.47 
 
 		 471 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  41.25 
 
 		 418 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  43.52 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  43.52 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  41.23 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  43.52 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  43.52 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  41.23 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  43.52 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  40.79 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  43.52 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  41.32 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  40.24 
 
 		 425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  37.29 
 
 		 422 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  40.24 
 
 		 425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  41 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  41 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  41 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  41 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40 
 
 		 418 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>