46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5083 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5083  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  236  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225516  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5379  protein of unknown function DUF423  73.64 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  60.82 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  67.39 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2349  hypothetical protein  67.39 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2306  protein of unknown function DUF423  67.83 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.454103  normal  0.0930723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  47.66 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  40.32 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  41.8 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  50.57 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  41.8 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  44.92 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  40.87 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  41.96 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  59.57 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0681  hypothetical protein  60.42 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  40.68 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3298  protein of unknown function DUF423  51.04 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00419882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01185  hypothetical protein  31.97 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004250  hypothetical protein  31.15 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000539124  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3262  protein of unknown function DUF423  44.62 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.319272 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3011  protein of unknown function DUF423  48.98 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  56.52 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3913  hypothetical protein  31.58 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2331  hypothetical protein  47.73 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02564  uncharacterized small membrane protein  35.9 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00480554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1480  hypothetical protein  41.56 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3306  hypothetical protein  31.62 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0654782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3126  hypothetical protein  31.62 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000001734  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3143  hypothetical protein  31.62 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00090815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3191  hypothetical protein  31.62 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0186134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3206  hypothetical protein  31.62 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3804  hypothetical protein  32.82 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00311639  unclonable  0.0000000190492 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3376  hypothetical protein  30.77 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2993  hypothetical protein  28.68 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4742  hypothetical protein  36.13 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0432  hypothetical protein  36.22 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4979  hypothetical protein  37.82 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5106  hypothetical protein  37.82 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.167348  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5073  hypothetical protein  28.81 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000730403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4169  hypothetical protein  38.05 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5185  hypothetical protein  28.81 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5487  hypothetical protein  28.81 
 
 		 122 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0895  protein of unknown function DUF423  33.33 
 
 		 120 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5090  hypothetical protein  28.81 
 
 		 122 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5521  hypothetical protein  29.66 
 
 		 122 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>