29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1116 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  84.81 
 
 		 237 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  64.29 
 
 		 243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  65.92 
 
 		 227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  63.27 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  64.8 
 
 		 243 aa  221  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  42.19 
 
 		 192 aa  142  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  42.93 
 
 		 195 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  42.11 
 
 		 195 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  41.45 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  42.27 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  42.63 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  42.78 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  41.21 
 
 		 203 aa  129  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  41.21 
 
 		 203 aa  129  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  41.75 
 
 		 192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  44.44 
 
 		 192 aa  125  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  40.11 
 
 		 192 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  41.52 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  36.32 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  40.84 
 
 		 200 aa  118  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  39.68 
 
 		 194 aa  118  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  38.54 
 
 		 191 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  41.21 
 
 		 188 aa  108  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  34.16 
 
 		 194 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  31.58 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  35.07 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  29.95 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  32.69 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>