More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0609 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0609  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
324 aa  658    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.83 
 
 
315 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
317 aa  362  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
317 aa  362  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
317 aa  362  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
317 aa  362  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
317 aa  362  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
317 aa  362  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
317 aa  362  3e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
317 aa  362  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
317 aa  362  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
317 aa  362  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.21 
 
 
317 aa  361  8e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.42 
 
 
329 aa  358  5e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.01 
 
 
315 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
324 aa  350  2e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  53.31 
 
 
327 aa  342  5e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.75 
 
 
316 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  52.96 
 
 
326 aa  335  5e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0043  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.18 
 
 
321 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.270111  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.57 
 
 
322 aa  334  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.75 
 
 
315 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
316 aa  328  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.11 
 
 
318 aa  325  9e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0018  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.5 
 
 
322 aa  324  1e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00325732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.55 
 
 
317 aa  323  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.43 
 
 
322 aa  323  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
319 aa  318  6e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.58 
 
 
319 aa  317  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.79 
 
 
313 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.47 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.42 
 
 
314 aa  314  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0535  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.31 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0143488  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0522  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.31 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00402651  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.6 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0138  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
321 aa  312  4.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.056526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.53 
 
 
316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
314 aa  309  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.53 
 
 
316 aa  309  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
318 aa  308  8e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.75 
 
 
327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.73 
 
 
321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.58 
 
 
314 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.89 
 
 
314 aa  305  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  47.45 
 
 
317 aa  305  7e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.73 
 
 
321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.73 
 
 
321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.42 
 
 
321 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.73 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1425  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.23 
 
 
323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000869959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1453  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.08 
 
 
316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.47 
 
 
314 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 
329 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.1 
 
 
324 aa  300  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.584149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  49.21 
 
 
312 aa  299  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.3 
 
 
338 aa  298  8e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.63 
 
 
325 aa  298  9e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0697  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50.97 
 
 
323 aa  297  1e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.99 
 
 
338 aa  295  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.83 
 
 
316 aa  294  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.78 
 
 
314 aa  293  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.81 
 
 
331 aa  293  4e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0101  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  48.12 
 
 
330 aa  293  4e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630999  hitchhiker  0.000002029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.08 
 
 
312 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.65 
 
 
312 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.42 
 
 
331 aa  290  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.79 
 
 
321 aa  290  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000509786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.44 
 
 
312 aa  289  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.44 
 
 
312 aa  288  9e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.77 
 
 
331 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.18 
 
 
315 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.22 
 
 
330 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.78 
 
 
317 aa  287  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.12 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.47 
 
 
337 aa  285  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.28 
 
 
315 aa  285  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.04 
 
 
330 aa  285  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2630  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.44 
 
 
320 aa  285  8e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 
314 aa  285  8e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.94 
 
 
323 aa  285  9e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 
314 aa  285  9e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.94 
 
 
323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.86 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.86 
 
 
320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.52 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.37 
 
 
318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.37 
 
 
318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.98 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.38 
 
 
327 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.54 
 
 
320 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 
312 aa  282  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.62 
 
 
309 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.17 
 
 
330 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.54 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.84 
 
 
331 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.147095  normal  0.740679 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.91 
 
 
318 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.86 
 
 
316 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0160  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  47.71 
 
 
336 aa  281  1e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.54 
 
 
317 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.23 
 
 
318 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>