23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1803 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1803  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000895551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2260  hypothetical protein  58.62 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1990  hypothetical protein  34.56 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0562007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3781  hypothetical protein  59.04 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185212  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  35.81 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3043  putative cointegrate resolution protein  43.82 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1887  hypothetical protein  30.84 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4307  hypothetical protein  36.47 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6604  hypothetical protein  34.12 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6443  hypothetical protein  34.12 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  37.68 
 
 		 351 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  32.46 
 
 		 348 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0184  hypothetical protein  34.88 
 
 		 346 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  hitchhiker  0.00509511 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  37.68 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0994  KfrAs  30.72 
 
 		 205 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0971877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1887  hypothetical protein  29.38 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.949228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  27.78 
 
 		 350 aa  45.8  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  37.68 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3578  mucin-associated surface protein  40.91 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00254533  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  43.48 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  34.78 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  40 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1892  hypothetical protein  28.05 
 
 		 207 aa  42.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>