254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0699 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0699  flavodoxin  100 
 
 
148 aa  294  2e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1148  flavodoxin  45.83 
 
 
147 aa  124  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000105619  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0539  flavodoxin  45.52 
 
 
147 aa  124  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000706098  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1386  flavodoxin  41.96 
 
 
152 aa  114  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1727  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.58 
 
 
149 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0628  flavodoxin  43.45 
 
 
147 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0056688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1393  flavodoxin  40 
 
 
150 aa  101  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000245556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  39.23 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0459  flavodoxin  34.69 
 
 
161 aa  86.3  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.728762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  39.23 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3555  flavodoxin  39.23 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000142004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  38.46 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  38.46 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  38.46 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  38.46 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  38.46 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  38.46 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  37.69 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  36.09 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1290  flavodoxin  33.33 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1262  flavodoxin  33.33 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1264  flavodoxin  33.33 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1465  flavodoxin  33.33 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1428  flavodoxin  33.33 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1492  flavodoxin  33.33 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3916  flavodoxin  34.59 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1534  flavodoxin  33.33 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1298  flavodoxin  31.97 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1394  flavodoxin  32.37 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  32.19 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000640858  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  32.28 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1951  flavodoxin  32.28 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000425319  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2007  flavodoxin FldA  31.71 
 
 
169 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  32.79 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  29.75 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  28 
 
 
1397 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  29.75 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  26.53 
 
 
1395 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  26.53 
 
 
1395 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  26.53 
 
 
1395 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  30.33 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  27.78 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  35.14 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  27.78 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  29.75 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  29.75 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  27.78 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  27.78 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  27.78 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  31.9 
 
 
883 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  27.78 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  27.78 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  29.29 
 
 
628 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  33.07 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.69 
 
 
1401 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  26.8 
 
 
1405 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  25.98 
 
 
1403 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  27.78 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.69 
 
 
610 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  27.45 
 
 
1397 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  34.21 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.08 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1186  flavodoxin  30.58 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35635  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  25.85 
 
 
1395 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  28.19 
 
 
631 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03036  flavodoxin  32.71 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.230795  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0794  flavodoxin FldA  31.85 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0860679  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  25.34 
 
 
1427 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11561  flavodoxin FldA  31.2 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.140927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4628  flavodoxin  27.78 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  30.61 
 
 
614 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4488  flavodoxin  27.78 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16491  flavodoxin FldA  32.35 
 
 
206 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.360226 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  26.72 
 
 
1400 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  31.03 
 
 
1317 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2583  flavodoxin FldA  29.58 
 
 
171 aa  51.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.285717  normal  0.227517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  27.97 
 
 
169 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  31.9 
 
 
623 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1692  flavodoxin  27.56 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4252  flavodoxin  30.17 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4309  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.73 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3903  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.08 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1584  flavodoxin FldA  29.29 
 
 
169 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.914641  hitchhiker  0.00800437 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4537  flavodoxin  28.93 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.186367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19660  flavodoxin  26.77 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.16255  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  26.02 
 
 
602 aa  50.1  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.5 
 
 
582 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  26.83 
 
 
1418 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  29.31 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  26.83 
 
 
1398 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  26.83 
 
 
1418 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.4 
 
 
626 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1356  flavodoxin FldA  30.16 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.267183 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  26.83 
 
 
1418 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  26.83 
 
 
1418 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.4 
 
 
629 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  30.08 
 
 
1312 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  26.83 
 
 
1418 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  26.83 
 
 
1418 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0376  flavodoxin FldA  33.05 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000140694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>