39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2372 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2372  UDP-N-acetylmuramoylpentapeptide-lysine N(6)-alanyltransferase  100 
 
 
396 aa  795    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  40.46 
 
 
403 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  34.78 
 
 
404 aa  249  4e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  33.92 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  29.18 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  29.18 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  27.44 
 
 
416 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  23.51 
 
 
415 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  23.58 
 
 
416 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  23.58 
 
 
416 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  24.69 
 
 
445 aa  97.1  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  24.69 
 
 
445 aa  97.1  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  23.64 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  23.64 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  25.2 
 
 
420 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  25.2 
 
 
420 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  24.29 
 
 
417 aa  89  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  23.59 
 
 
360 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1029  hypothetical protein  23.06 
 
 
422 aa  87  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  25.13 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  22.33 
 
 
417 aa  76.3  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  25 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  20.35 
 
 
419 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  20.35 
 
 
419 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1442  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.51 
 
 
422 aa  65.1  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0327  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  21.96 
 
 
417 aa  59.7  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.297856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  25.71 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1028  hypothetical protein  20.48 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  24.17 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  21.45 
 
 
354 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  22.35 
 
 
370 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  39.39 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  22.1 
 
 
339 aa  51.6  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0508  beta-lactam resistance factor  21.35 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0830649  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0882  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  22.22 
 
 
388 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1027  hypothetical protein  18.85 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  20.05 
 
 
437 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0644  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  22.58 
 
 
411 aa  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0386  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  22.82 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>