41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1962 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1962  hypothetical protein  100 
 
 
936 aa  1884    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3220  hypothetical protein  28.82 
 
 
1275 aa  106  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  27.81 
 
 
1198 aa  105  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2085  hypothetical protein  27.98 
 
 
1263 aa  95.1  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0274  hypothetical protein  26 
 
 
1009 aa  86.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0267  hypothetical protein  26 
 
 
1009 aa  86.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  25.97 
 
 
1197 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1038  phage infection protein, putative  27.83 
 
 
1003 aa  73.2  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.687309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  31.48 
 
 
721 aa  58.5  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  31.48 
 
 
721 aa  57.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  22.25 
 
 
953 aa  57  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  20.51 
 
 
769 aa  55.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  26.45 
 
 
941 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  25.81 
 
 
953 aa  54.7  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  25.81 
 
 
953 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  25.81 
 
 
941 aa  53.5  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  32.53 
 
 
954 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  25.81 
 
 
941 aa  53.5  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  25 
 
 
981 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  25.81 
 
 
991 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  25.81 
 
 
953 aa  52.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 
993 aa  52.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 
993 aa  52.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  25.81 
 
 
981 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  22.56 
 
 
797 aa  50.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  21.59 
 
 
940 aa  49.7  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  21.21 
 
 
666 aa  48.9  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  21.21 
 
 
666 aa  48.9  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  21.83 
 
 
666 aa  49.3  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  21.21 
 
 
666 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  24.22 
 
 
772 aa  48.1  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  24.02 
 
 
789 aa  46.2  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  20.71 
 
 
666 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  22.54 
 
 
666 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  21.82 
 
 
720 aa  45.1  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.89 
 
 
737 aa  45.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  34.92 
 
 
785 aa  45.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.28 
 
 
857 aa  45.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  21.98 
 
 
718 aa  44.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  20.25 
 
 
663 aa  44.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  25 
 
 
754 aa  44.3  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>