More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_27040 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_27040  LSU ribosomal protein L34P  100 
 
 		 45 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23480  LSU ribosomal protein L34P  86.67 
 
 		 45 aa  76.6  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4172  50S ribosomal protein L34  86.67 
 
 		 45 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000696082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7341  50S ribosomal protein L34  80 
 
 		 45 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5415  50S ribosomal protein L34  84.44 
 
 		 45 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4548  50S ribosomal protein L34  82.22 
 
 		 45 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0003403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9389  50S ribosomal protein L34P  82.22 
 
 		 45 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0319883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4513  ribosomal protein L34  80 
 
 		 45 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4225  ribosomal protein L34  82.22 
 
 		 45 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6487  50S ribosomal protein L34  82.22 
 
 		 45 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00156279  normal  0.0851435 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31980  LSU ribosomal protein L34P  82.22 
 
 		 45 aa  70.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  80 
 
 		 45 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3730  ribosomal protein L34  80 
 
 		 49 aa  70.5  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.458139 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2558  ribosomal protein L34  77.78 
 
 		 45 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000028537  normal  0.271528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38060  LSU ribosomal protein L34P  77.78 
 
 		 49 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4593  50S ribosomal protein L34  77.78 
 
 		 45 aa  69.3  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000549229  decreased coverage  0.0000848449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5096  ribosomal protein L34  80 
 
 		 45 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  83.72 
 
 		 44 aa  69.3  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3379  ribosomal protein L34  80 
 
 		 45 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4243  ribosomal protein L34  81.4 
 
 		 47 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0239803  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2161  50S ribosomal protein L34  77.78 
 
 		 45 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5111  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 		 45 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480023  unclonable  0.0000000124693 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3117  50S ribosomal protein L34  77.78 
 
 		 47 aa  67.4  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4868  ribosomal protein L34  75.56 
 
 		 47 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000339328  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7100  ribosomal protein L34  79.07 
 
 		 47 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161616  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4864  ribosomal protein L34  81.4 
 
 		 47 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0828  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 47 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6078  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 47 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0153372  normal  0.186265 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13959  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 47 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4700  50S ribosomal protein L34P  68.89 
 
 		 45 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5789  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 47 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885674  normal  0.0150043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5413  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 47 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0008  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 47 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0331867  normal  0.0953733 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0046  ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  65.12 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39800  LSU ribosomal protein L34P  80 
 
 		 45 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000714138  normal  0.545071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1059  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202626  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.054761 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1437  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0070  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0872  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 45 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 50 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0642  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 45 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0779335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4138  ribosomal protein L34  57.78 
 
 		 45 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00368218  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 53 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 53 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 48 aa  57.4  0.00000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  65.12 
 
 		 44 aa  57  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 51 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 47 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 53 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 53 aa  57  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3852  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 52 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 52 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  64.29 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 52 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0333  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 53 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 51 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0220  50S ribosomal protein L34P  57.78 
 
 		 51 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0313  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4985  ribosomal protein L34  81.25 
 
 		 45 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  60 
 
 		 45 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  60 
 
 		 45 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3596  50S ribosomal protein L34  78.12 
 
 		 45 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0964891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 53 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 55 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 46 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  60.47 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 45 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1793  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000343039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1923  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360923  normal  0.510099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  61.9 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>