39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26800 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_26800  glycosyl transferase  100 
 
 
617 aa  1210    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26830  hypothetical protein  38.6 
 
 
629 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0373  hypothetical protein  34.69 
 
 
685 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  34.68 
 
 
694 aa  265  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  30.62 
 
 
641 aa  177  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1469  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
267 aa  134  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0618  glycosyl transferase family 2  36.31 
 
 
670 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.958983  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0624  glycosyltransferase  28.44 
 
 
249 aa  124  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1644  hypothetical protein  33.04 
 
 
373 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.946306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1635  hypothetical protein  33.48 
 
 
650 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168505  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0876  hypothetical protein  28.23 
 
 
671 aa  105  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.912844  normal  0.438141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0881  family 2 glycosyl transferase  30.18 
 
 
369 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0634  hypothetical protein  31.43 
 
 
513 aa  94.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.135526 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4580  hypothetical protein  31.45 
 
 
429 aa  93.6  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1641  hypothetical protein  27.14 
 
 
640 aa  91.3  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4584  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
546 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5365  hypothetical protein  20.46 
 
 
855 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5124  hypothetical protein  20.46 
 
 
855 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4970  bifunctional hypothetical protein/glycosyltransferase  21.02 
 
 
1176 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5516  hypothetical protein  20.46 
 
 
854 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4980  hypothetical protein  20.92 
 
 
706 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3317  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  33.91 
 
 
314 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  34.91 
 
 
286 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0640  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
321 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  25.98 
 
 
1498 aa  48.5  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0011  putative glycosyltransferase  28.21 
 
 
320 aa  48.5  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.171814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.05 
 
 
957 aa  47.4  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
397 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
307 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 
872 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1357  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
293 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
351 aa  45.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
1250 aa  45.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  21.48 
 
 
2112 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
307 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
333 aa  44.7  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
310 aa  44.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
310 aa  43.9  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0211  glycosyltransferase  26.38 
 
 
321 aa  43.9  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>