31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1644 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1644  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  729    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.946306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0881  family 2 glycosyl transferase  64.21 
 
 
369 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1641  hypothetical protein  44.7 
 
 
640 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0618  glycosyl transferase family 2  47.52 
 
 
670 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.958983  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0634  hypothetical protein  45.11 
 
 
513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.135526 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4584  glycosyl transferase family protein  44.33 
 
 
546 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4580  hypothetical protein  44.09 
 
 
429 aa  182  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26830  hypothetical protein  38.89 
 
 
629 aa  129  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26800  glycosyl transferase  33.04 
 
 
617 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  36.44 
 
 
641 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  33.17 
 
 
694 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0373  hypothetical protein  32.2 
 
 
685 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1469  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0624  glycosyltransferase  27.71 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1635  hypothetical protein  33.01 
 
 
650 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168505  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0876  hypothetical protein  31.19 
 
 
671 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.912844  normal  0.438141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2255  glycosyl transferase, group 1/glycosyl transferase, group 2  26.06 
 
 
740 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2747  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
277 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.510673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2763  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 
613 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.618349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0933  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 
623 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3094  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.96 
 
 
613 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3131  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.96 
 
 
613 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1842  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 
613 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.471452  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3154  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 
613 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4814  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
308 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5052  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 
897 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00429729  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1479  putative glycosyl transferase  26.23 
 
 
613 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  23.12 
 
 
292 aa  43.5  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>