19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4584 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4584  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
546 aa  1038    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4580  hypothetical protein  48.64 
 
 
429 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0618  glycosyl transferase family 2  42.97 
 
 
670 aa  250  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.958983  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1641  hypothetical protein  49.2 
 
 
640 aa  249  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0634  hypothetical protein  47.08 
 
 
513 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.135526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1644  hypothetical protein  45.98 
 
 
373 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.946306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0881  family 2 glycosyl transferase  46.11 
 
 
369 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  33.63 
 
 
641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26800  glycosyl transferase  33.45 
 
 
617 aa  111  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  34.26 
 
 
694 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0373  hypothetical protein  36.1 
 
 
685 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26830  hypothetical protein  34.09 
 
 
629 aa  98.2  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1469  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1635  hypothetical protein  32.11 
 
 
650 aa  70.5  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168505  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0624  glycosyltransferase  25.24 
 
 
249 aa  55.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0876  hypothetical protein  29.94 
 
 
671 aa  47.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.912844  normal  0.438141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
350 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1832  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
318 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.52931  hitchhiker  0.00130568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1062  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
318 aa  43.5  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.851458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>