24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1635 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1635  hypothetical protein  100 
 
 
650 aa  1286    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168505  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0876  hypothetical protein  42.51 
 
 
671 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.912844  normal  0.438141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0373  hypothetical protein  30.5 
 
 
685 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  30.29 
 
 
694 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26830  hypothetical protein  30.73 
 
 
629 aa  183  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  29.04 
 
 
641 aa  143  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26800  glycosyl transferase  33.33 
 
 
617 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4970  bifunctional hypothetical protein/glycosyltransferase  22.41 
 
 
1176 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5516  hypothetical protein  20.57 
 
 
854 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5365  hypothetical protein  20.57 
 
 
855 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5124  hypothetical protein  20.57 
 
 
855 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1469  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
267 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  23.73 
 
 
2112 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0624  glycosyltransferase  28.99 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0618  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
670 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.958983  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4580  hypothetical protein  31.6 
 
 
429 aa  70.5  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1644  hypothetical protein  33.01 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.946306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0881  family 2 glycosyl transferase  31.34 
 
 
369 aa  66.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0634  hypothetical protein  29.47 
 
 
513 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.135526 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4980  hypothetical protein  18.84 
 
 
706 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415401  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4584  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
546 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1641  hypothetical protein  26.67 
 
 
640 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1194  methyltransferase FkbM family  31.97 
 
 
1498 aa  52  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.288288 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
509 aa  44.3  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>