26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23940 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23940  hypothetical protein  100 
 
 		 1217 aa  2336    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24380  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1670 aa  178  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694198  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1400 aa  178  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1407 aa  167  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1506 aa  153  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1499 aa  147  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16460  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1254 aa  145  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  28.93 
 
 		 1412 aa  136  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  26.08 
 
 		 1413 aa  131  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1392 aa  112  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3697  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1274 aa  105  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1670  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1207 aa  103  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0229  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1252 aa  95.5  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  24.56 
 
 		 2207 aa  58.2  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  30.05 
 
 		 1877 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  23.37 
 
 		 1958 aa  51.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  28.49 
 
 		 2005 aa  51.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  23.81 
 
 		 1803 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  26.89 
 
 		 1853 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  21.24 
 
 		 1722 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1888 aa  48.5  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  22.31 
 
 		 2198 aa  48.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  30.63 
 
 		 1571 aa  47.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  26.03 
 
 		 2125 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  26.03 
 
 		 2125 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  30 
 
 		 1980 aa  45.8  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>