43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15580 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_15580  alpha/beta hydrolase family protein  100 
 
 
405 aa  815    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1592  secreted protein  47.01 
 
 
392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121607  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1663  secreted protein  39.95 
 
 
443 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1656  secreted protein  38.68 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000081401 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12930  hypothetical protein  39.21 
 
 
466 aa  228  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13780  alpha/beta hydrolase family protein  34.18 
 
 
451 aa  193  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0659  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  36.78 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6355  hypothetical protein  27.49 
 
 
337 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  29.88 
 
 
290 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0384  hypothetical protein  22.61 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  23.18 
 
 
313 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  28.77 
 
 
295 aa  56.2  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  26.78 
 
 
312 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl482  putative lipase  20.32 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.41792  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  25 
 
 
337 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0739  hypothetical protein  19.29 
 
 
382 aa  49.7  0.00009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2712  hypothetical protein  20 
 
 
322 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00940058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  24.48 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  21.01 
 
 
307 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  24.24 
 
 
294 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  25 
 
 
283 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  23.85 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  31.87 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 
288 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  34.07 
 
 
319 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  24.4 
 
 
320 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  29.37 
 
 
295 aa  46.6  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.79 
 
 
314 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  32.97 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  24.35 
 
 
305 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.05 
 
 
297 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  31.87 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  25.79 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  32.97 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2402  hypothetical protein  23.55 
 
 
206 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2777  hypothetical protein  23.55 
 
 
206 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.958453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 
319 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  20.08 
 
 
307 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  27.87 
 
 
305 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  25.53 
 
 
325 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  25.9 
 
 
285 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  20.94 
 
 
308 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  20.08 
 
 
307 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>