More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09160 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  100 
 
 
464 aa  912    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  55.88 
 
 
468 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  51.32 
 
 
470 aa  428  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  54.25 
 
 
452 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  50 
 
 
466 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  54.71 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2567  FolC bifunctional protein  53.28 
 
 
477 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  49.33 
 
 
452 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  51.36 
 
 
462 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  51.36 
 
 
460 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  52.07 
 
 
515 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  54 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  54 
 
 
526 aa  398  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  52.33 
 
 
517 aa  397  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  51.24 
 
 
450 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  49.24 
 
 
471 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  52.02 
 
 
444 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  48.88 
 
 
452 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  51.31 
 
 
444 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1582  FolC bifunctional protein  50.56 
 
 
447 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7289  FolC bifunctional protein  52.46 
 
 
515 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  47.61 
 
 
508 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  49.62 
 
 
463 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12473  folylpolyglutamate synthase protein folC  46.59 
 
 
487 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.669208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1469  FolC bifunctional protein  47.78 
 
 
471 aa  361  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0493364  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  52.3 
 
 
448 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  49.54 
 
 
443 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3562  FolC bifunctional protein  48.21 
 
 
467 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.523756  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3557  FolC bifunctional protein  47.99 
 
 
467 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.011361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3630  FolC bifunctional protein  47.99 
 
 
467 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.299484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3950  FolC bifunctional protein  46.58 
 
 
471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2631  FolC bifunctional protein  46.9 
 
 
471 aa  338  8e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121718  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  47.98 
 
 
448 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  48.17 
 
 
445 aa  333  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  46.44 
 
 
468 aa  332  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  42.48 
 
 
485 aa  322  6e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  42.02 
 
 
543 aa  322  6e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  34.28 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  34.61 
 
 
429 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  37.17 
 
 
440 aa  229  8e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  37.01 
 
 
445 aa  226  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  32.08 
 
 
438 aa  224  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  34.62 
 
 
434 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  31.82 
 
 
437 aa  218  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  31.82 
 
 
435 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  34.53 
 
 
431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  35.08 
 
 
438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  39.26 
 
 
426 aa  212  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  35.25 
 
 
459 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  31.74 
 
 
441 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  32.55 
 
 
435 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  31.65 
 
 
441 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  35.65 
 
 
431 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  35.25 
 
 
429 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  30.2 
 
 
413 aa  206  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.48 
 
 
466 aa  205  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  31.35 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2653  FolC bifunctional protein  36.96 
 
 
422 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  30.44 
 
 
431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  36.49 
 
 
424 aa  200  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  34.2 
 
 
439 aa  199  7e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  32.78 
 
 
437 aa  199  7e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  29.74 
 
 
428 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  32.71 
 
 
431 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  34.2 
 
 
424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  34.2 
 
 
437 aa  197  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  31.43 
 
 
432 aa  196  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  28.86 
 
 
465 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  34.8 
 
 
433 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1821  FolC bifunctional protein  38.28 
 
 
428 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  30.4 
 
 
433 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  31.16 
 
 
416 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  29.93 
 
 
433 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  33.72 
 
 
437 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  30.17 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  30.17 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  30.17 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.93 
 
 
433 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  31.91 
 
 
424 aa  189  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  27.63 
 
 
432 aa  189  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.21 
 
 
433 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  31.07 
 
 
407 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.93 
 
 
433 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  30.41 
 
 
451 aa  186  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  29.93 
 
 
433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  37.66 
 
 
414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  34.52 
 
 
424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  35.1 
 
 
422 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1209  folylpolyglutamate synthase-like  36.23 
 
 
476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503356  normal  0.49053 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  34.87 
 
 
878 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  39.55 
 
 
425 aa  183  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
433 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  37.44 
 
 
461 aa  182  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  31.73 
 
 
425 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  36.09 
 
 
441 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  31.69 
 
 
474 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.69 
 
 
433 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  32.28 
 
 
424 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  35.54 
 
 
428 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  28.74 
 
 
433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>