13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3136 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3136  SAF domain protein  100 
 
 		 241 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000294496  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  33.33 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  31.62 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1304  hypothetical protein  32.33 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1358  SAF domain-containing protein  36.91 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0669  SAF domain protein  33.87 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2220  SAF domain-containing protein  36.28 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4144  hypothetical protein  32.14 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.810399  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2596  SAF domain-containing protein  36.36 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.936822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3417  SAF domain protein  32.41 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1738  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00359989  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1221  SAF domain protein  35.77 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4972  SAF domain-containing protein  31.54 
 
 		 219 aa  42  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>