168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2074 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2074  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  100 
 
 
292 aa  564  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.334644  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1809  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  52.09 
 
 
271 aa  242  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2788  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  57.6 
 
 
273 aa  239  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000742326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5280  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  50.36 
 
 
275 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.970105  normal  0.551146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4658  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  48.85 
 
 
275 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1729  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  50.18 
 
 
271 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0200  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  48.09 
 
 
298 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3421  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  48.78 
 
 
323 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2048  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  49.45 
 
 
271 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1085  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  50 
 
 
271 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.196121  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2049  hypothetical protein  44.7 
 
 
275 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1288  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  45.65 
 
 
276 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2694  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.49 
 
 
282 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  49.43 
 
 
260 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.955887  hitchhiker  0.00580332 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3201  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  43.9 
 
 
310 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4792  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  49.45 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239471  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2636  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  45.71 
 
 
262 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2968  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  41.83 
 
 
1139 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1512  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.21 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.78 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.42 
 
 
292 aa  63.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.34 
 
 
490 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1444  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.21 
 
 
280 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1137  dehydrogenase  22.34 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  27.72 
 
 
499 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0669  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.33 
 
 
272 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.230541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  30.2 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1423  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  23.95 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2176  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.93 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2774  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  36.3 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3104  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.77 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0450134  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.17 
 
 
468 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.12 
 
 
480 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5750  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.86 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.436516  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5517  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  42.86 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0767  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  21.76 
 
 
281 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225703 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.13 
 
 
288 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  35.22 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.19 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0415  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  42.03 
 
 
284 aa  57  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6669  Carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  32.28 
 
 
289 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182212 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2646  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.73 
 
 
283 aa  56.2  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2185  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.72 
 
 
292 aa  55.8  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.27538  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3595  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.49 
 
 
288 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  29.22 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2949  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.95 
 
 
273 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000190078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.17 
 
 
467 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.09 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2772  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.9 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137285  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4317  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.27 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1210  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.35 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0358548  normal  0.452165 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  27.82 
 
 
288 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.29 
 
 
481 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.82 
 
 
288 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3872  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.55 
 
 
285 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1959  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  35.53 
 
 
294 aa  52.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2230  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.22 
 
 
291 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1167  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.95 
 
 
287 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.35 
 
 
496 aa  52.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2134  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein-like  25.43 
 
 
289 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.4 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2020  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.73 
 
 
292 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  39.19 
 
 
480 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1218  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  31.32 
 
 
296 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  44.59 
 
 
467 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  28 
 
 
450 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.63 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1747  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  38.1 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.795465  normal  0.613894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10380  carbon monoxyde dehydrogenase medium subunit  30.15 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121172  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0473  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.95 
 
 
276 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4923  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.65 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1676  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.62 
 
 
301 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.991973  normal  0.682256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3113  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  27.66 
 
 
290 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203771  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  37.4 
 
 
461 aa  49.7  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2232  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  37.93 
 
 
288 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.894157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1334  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  43.24 
 
 
295 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332436 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2680  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  22.92 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.94 
 
 
305 aa  49.3  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.89 
 
 
467 aa  49.3  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0530  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  41.43 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.35 
 
 
518 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0974  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.34 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101197  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.21 
 
 
484 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  25.29 
 
 
483 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0643  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.98 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.61 
 
 
493 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1638  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  25.19 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.921721  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  29.91 
 
 
488 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  31.86 
 
 
485 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0299  glyceraldehyde oxidoreductase medium chain  29.19 
 
 
280 aa  47  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3192  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  25 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4200  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  31.66 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.690695 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.62 
 
 
485 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.62 
 
 
485 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3208  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.33 
 
 
291 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.426898  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4711  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  39.19 
 
 
306 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728749  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.29 
 
 
512 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0825  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25 
 
 
292 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>