25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1069 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1069  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
244 aa  472  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2886  lipolytic protein G-D-S-L family  30.57 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0666  lipolytic protein G-D-S-L family  29.95 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0932  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.91 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2818  GDSL family lipase  31.47 
 
 
316 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1651  GDSL family lipase  30.73 
 
 
253 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  29.08 
 
 
340 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3835  hypothetical protein  29.17 
 
 
238 aa  52  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0629406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  29.47 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5029  putative lipase/acylhydrolase, GDSL-like protein  32.23 
 
 
444 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000311483  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10529  hypothetical protein  28.93 
 
 
231 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  29.13 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  28.77 
 
 
289 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  26.04 
 
 
358 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2536  lipolytic enzyme, G-D-S-L family  27.57 
 
 
304 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000551868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  25.63 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2715  GDSL family lipase  29.17 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.213163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.17 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2729  GDSL family lipase  29.17 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.623881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  28.35 
 
 
287 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  24.27 
 
 
593 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  24.02 
 
 
362 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  29.8 
 
 
266 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  24.55 
 
 
197 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  28.79 
 
 
254 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>