16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0266 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0266  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  283  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.431881  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18530  hypothetical protein  38.41 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6286  hypothetical protein  34.67 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4855  hypothetical protein  29.87 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457667  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1808  hypothetical protein  30.07 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0352824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6270  hypothetical protein  31.25 
 
 		 171 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.481188  normal  0.278724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0369  hypothetical protein  34.25 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3242  hypothetical protein  32.62 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1774  hypothetical protein  32.19 
 
 		 171 aa  48.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0708  hypothetical protein  34.48 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4939  hypothetical protein  36 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2040  hypothetical protein  31.62 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1123  hypothetical protein  31.25 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1233  hypothetical protein  31.25 
 
 		 178 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0143  hypothetical protein  31.29 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>